Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf3c3Q3TMP1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c3Q3TMP1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms