Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Prr27Q3SYJ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prr27Q3SYJ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prr27Q3SYJ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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