Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim71Q1PSW8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim71Q1PSW8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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