Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam171bQ14CH0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms