Protein–RNA interactions for Protein: Q149T7

Ppm1j, Protein phosphatase 1J, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1jQ149T7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ppm1jQ149T7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ppm1jQ149T7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms