Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VgfQ0VGU4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VgfQ0VGU4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms