Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gli2Q0VGT2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms