Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lrriq1Q0P5X1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Lrriq1Q0P5X1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lrriq1Q0P5X1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrriq1Q0P5X1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrriq1Q0P5X1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms