Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kndc1Q0KK55 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms