Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf541Q0GGX2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf541Q0GGX2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms