Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms