Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssrp1Q08943 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms