Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah1bQ06985 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms