Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprgQ05909 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprgQ05909 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms