Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx2Q04744 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx2Q04744 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms