Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms