Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ascl1Q02067 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms