Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp1Q01514 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp1Q01514 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms