Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec23aQ01405 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec23aQ01405 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms