Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2bQ01097 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin2bQ01097 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms