Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms