Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd80Q00609 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd80Q00609 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms