Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tarbp2P97473 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms