Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1bP97358 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1bP97358 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms