Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf1aP97357 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms