Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf3P70671 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms