Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdh10P70408 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms