Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Msx3P70354 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx3P70354 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms