Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smad1P70340 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smad1P70340 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Smad1P70340 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smad1P70340 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smad1P70340 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms