Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Traf6P70196 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Traf6P70196 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms