Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab1P63143 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnab1P63143 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms