Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg6P61406 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg6P61406 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg6P61406 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms