Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sem1P60897 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms