Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms