Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ythdf1P59326 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ythdf1P59326 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms