Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms