Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcd5P56812 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms