Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TdgP56581 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TdgP56581 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TdgP56581 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TdgP56581 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TdgP56581 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TdgP56581 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TdgP56581 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TdgP56581 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TdgP56581 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TdgP56581 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms