Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lim2P56563 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms