Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms