Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2bP55271 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms