Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms