Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Efnb1P52795 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb1P52795 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms