Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LumP51885 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LumP51885 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LumP51885 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LumP51885 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LumP51885 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms