Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr4P51680 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms