Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csrp3P50462 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms