Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ArsaP50428 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ArsaP50428 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms