Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod1P49813 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms