Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hnrnpa1P49312 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hnrnpa1P49312 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hnrnpa1P49312 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hnrnpa1P49312 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hnrnpa1P49312 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hnrnpa1P49312 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms