Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp3P49194 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp3P49194 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms